〇隠しキャラ
名前 条件
インプモン いずれかの対戦キャラクターに乱入してくる。
エンディング後はデジタルワールドで戦うことができる。
UNKNOWN1 所持カードの総枚数が250枚以上だと乱入してくる。
エンディング後はデジタルワールドで戦うことができる。
UNKNOWN2 所持カードの総枚数が300枚以上だと乱入してくる。
エンディング後はデジタルワールドで戦うことができる。
UNKNOWN3 所持カードの総枚数が275枚以上だと乱入してくる。
エンディング後はデジタルワールドで戦うことができる。
太一&ヤマト 通信対戦を7回行うor対CPU戦を80回行うと出現。

〇隠しイベント
対戦で特定の条件を満たすとカードがもらえる。
条件 もらえるカード
デジタルワールドのタカトに5勝 グラニ
デジタルワールドのタカトに10勝 好敵手はワクチン!
デジタルワールドのタカトに15勝 ウィルスバスターズ
デジタルワールドのルキに5勝 究極のコネクション
デジタルワールドのルキに10勝 実はキミ……飛べないの?
デジタルワールドのルキに15勝 MAXチャージャー
デジタルワールドのジェンに5勝 メタルエンパイア
デジタルワールドのジェンに10勝 究極合体デジモンへの融合!
デジタルワールドのジェンに15勝 ホーリーオーブ
対CPU戦に12勝 キングデヴァイス
対CPU戦に24勝 ナイトデヴァイス
対CPU戦に36勝 ルークデヴァイス
対CPU戦に4敗 防御プラグインG
対CPU戦に8敗 スカイシティ
対CPU戦に12敗 デュークモンクリムゾンモード